Anh cưới Karen Benedit vào tháng 2 năm 2005 sau khi hẹn hò từ năm 2003. Cô sinh ở Atlanta năm 1975.

Joe cũng là một fan phim Transformers. Trong một phim tài liệu từ lâu tên "Linkin Park: Live at Filmore", bàn quay đĩa của Joe có biểu tượng của Decepticon. Trong tập 3 của LPTV ở Summer Sanitarium, có thể thấy anh mặc một áo thun có biểu tượng Decepticon. Anh cũng là người khuyên ban nhạc nên đưa đĩa đơn What I've Done vào phần nhạc nền cho phim Transformers. Joe cùng với Rob và Chester làm đại diện ở buổi công chiếu phim Transformers.

Joe được biết đến với tính hài hước cụt lủn và sự thông thái trong hầu hết các cuộc phỏng vấn. Người bạn ruột của anh, biết đến với cái tên "Remy" có thể được nghe thấy ở đoạn đầu bài từ Hybrid Theory, "Cure for the Itch".